O Desafio Online do Fundamental II foi composto de sete enigmas lógicos que possui resposta única para cada um deles. Os alunos muniram-se com conhecimentos ensinados em sala de aula e pistas na internet. Durante cada desafio proposto houve uma interação do professor com os alunos, que sistematicamente fornecia dicas a fim de atingir o resultado da resposta de cada enigma, isso tudo a partir da ótica da turma. A pontuação final de cada turma se deu pela quantidade de dicas utilizada; quanto menos dicas mais pontos somavam-se a turma. Por fim, a turma que respondeu aos enigmas utilizando-se de menos dicas, fica em primeiro lugar.